网站原创摘 要 :蛋白质翻译后修饰, 是指在mRNA被翻译成蛋白质后, 对蛋白质上个别氨基酸残基进行共价修饰,翻译后修饰鉴定是蛋白质序列鉴定中重要的研究内容之一.大量的质谱数据无法被鉴定或是鉴定的精度不够高,特别是在肽段数据库较大时,普通的算法精度下降很快.提出一种新的盲搜索算法,此算法基于一种全新的基于相似关系度量的打分模型.为了处理大规模问题,同时还应用了基于母离子质量和肽序列标签的前过滤方法,使得此算法在较大规模的数据库上精度得到很好的保证.实验结果表明,对于规模为10000, 20000, 50000的肽段数据库,其鉴定准确率分别为78.3%,74.2%,65.5%.随着数据库规模的增大,算法的鉴定准确率保持得较好.
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关 键 词 ：肽序列标签；翻译后修饰；质谱；盲搜索；大规模
中图分类号: TP391；TP392文献标志码:A